W encefalopatii wątrobowej wątroba nie pracuje prawidłowo. Przyczyn tego stanu jest bardzo wiele - od wirusowego zapalenia wątroby po marskość wątroby, działanie wybranych leków, krwotok do przewodu pokarmowego czy substancje toksyczne. W wyniku zaburzeń w funkcjonowaniu wątroby dochodzi do uszkodzenia centralnego układu nerwowego oraz zaburzeń fizycznych i psychicznych. Przyczyniają się do tego nagromadzone w organizmie toksyny jak np. amoniak, fenole, mangan, beta-fenyloalanina czy kwasy tłuszczowe.
Choroba ta wymaga specjalistycznego leczenia na oddziale szpitalnym.