Złośliwy zespół neuroleptyczny może mieć podobne objawy do autoimmunologicznego zapalenia mózgu z obecnością przeciwciał anty-NMDAR.

Złośliwy zespół neuroleptyczny oraz zespół serotoninowy mogą często mieć podobne objawy do autoimmunologicznego zapalenia mózgu.

Pacjenci z autoimmunologicznym zapaleniem mózgu z obecnością przeciwciał anty-NMDAR mogą rozwinąć psychozę jako początkowy objaw i być w związku z tym leczone neuroleptykami. Następnie przechodzą do katatonii, sztywności, niestabilności autonomicznej i zmienionego poziomu świadomości. Tego typu objawy mogą być błędnie uznane za złośliwy zespół neuroleptyczny. W rzeczywistości są to objawy autoimmunologicznego zapalenia mózgu z obecnością przeciwciał anty-NMDAR.
Cytat:
,,Intoxications such a neuroleptic malignant syndrome and serotonin syndrome may often present with similarities to autoimmune encephalitis. Conversely, patients with anti-NMDAR encephalitis may develop psychosis as an initial symptom and be treated with neuroleptics, then later show catatonia, rigidity, autonomic instability and altered level of consciousness; this pattern of findings may be mistaken for neuroleptic malignant syndrome. Autoimmune encephalitis therefore should enter into the differential diagnosis of any case of suspected neuroleptic malignant syndrome (Patients with anti-NMDAR encephalitis may be particularly sensitive to strong dopamine antagonists, and our group attempts to avoid using these medications)."
Artykuł:
,,The Diagnosis and Treatment of Autoimmune Encephalitis"

Autoimmunologiczne zapalenia mózgu powinny zatem wejść w diagnostykę różnicową każdego przypadku podejrzenia złośliwego zespołu neuroleptycznego.
Cytat:
,,Autoimmune encephalitis therefore should enter into the differential diagnosis of any case of suspected neuroleptic malignant syndrome (Patients with anti-NMDAR encephalitis may be particularly sensitive to strong dopamine antagonists, and our group attempts to avoid using these medications)."
Artykuł:
,,The Diagnosis and Treatment of Autoimmune Encephalitis"

Chłoniak lub nowotworowe zapalenie opon mózgowych może mieć podobną prezentację jak autoimmunologiczne zapalenie mózgu.
Cytat:
,,Lymphoma or carcinomatous meningitis may present similarly to autoimmune encephalitis.36 Particularly, symptoms may have a subacute onset and involve multiple cranial neuropathies. Both may occur in patients with or without known tumors. Repeating CSF cytology, awareness of known tumors, and screening for malignancy may all help lead to recognition of these causes."
Artykuł:
,,The Diagnosis and Treatment of Autoimmune Encephalitis"

Dobrze jest ustalić czy pacjent z zapaleniem mózgu nie przebywał na terenach endemicznych dla danej choroby.
Podróż na tereny endemiczne gdzie występuje borelioza może być pewną wskazówką, że dana osoba cierpi na neuroboreliozę.
Podróż na teren endemiczne gdzie panuje malaria czyli ryzyko malarii mózgowej itp.

Dobrze jest rozpatrzyć czy pacjent z zapaleniem mózgu nie miała kontaktu z osobą chorą na gruźlicę czyli ewentualne ryzyko gruźlicy ośrodkowego układu nerwowego.

Trzeba również rozpatrzyć czy pacjent z zapaleniem mózgu nie miał kontaktu z osobą lub osobami, od których mógł zarazić się jakąś chorobą.

Badanie przeciwciał jest niezwykle ważne dla właściwej diagnozy autoimmunologicznego zapalenia mózgu.

Testowanie przeciwciał anty-NMDAR oraz innych przeciwciał przeciwko antygenom powierzchniowym z płynu mózgowo- rdzeniowego jest najbardziej czułe i swoiste.
Cytat:
,,NMDAR and other cell surface antibody tests are most sensitive and specific with CSF."
Artykuł:
,,The Diagnosis and Treatment of Autoimmune Encephalitis"