Migrena to dość częsta dolegliwość, która towarzyszy mitochondriopatii czyli problemom z produkcją energii przez specjalne organelle komórkowe - mitochondria. W medycynie ortomolekularnej dobre wyniki przynosi suplementacja witaminą B2 oraz B3, witaminą C, magnezem (cytrynian lub jabłczan w tym przypadku) oraz koenzymem Q10. Generalnie przyczynowe leczenie migreny obejmuje terapię mitochondrialną, która przy okazji pomaga leczyć inne choroby wieloukładowe, jakie towarzyszą temu schorzeniu, takie jak: cukrzyca, zespół metaboliczny, depresja czy
fibromialgia.